2012年第二季度，银行体系的不良贷款余额就增加了182亿元，给银行内控体系和案件防控带来的诸多压力。受机构多、覆盖面广、员工素质等因素影响，农村信用社信贷领域风险最大，风险管控有待进一步提高，问题整改力度亟待加强。

以票据业务为例，近年来爆发的票据不合规风险基本集中在农村金融机构、城商行等中小银行金融机构。

目前，部分农村金融机构、城商行未配置票据真伪查验设备、承兑人超过制度规定范围、会计核算不准确、科目归属错误、信贷管理系统数据录入错误、贴现协议不规范等严重违规操作行为。在经济下行、信用风险爆发的大背景下，农信社的问题可能更加迫在眉睫。