近年来，我国票据融资业务快速发展，金融机构以开具银行承兑汇票的形式代替直接发放贷款；部分人利用金融机构差额银行承兑汇票业务非法买卖票据；部分金融机构超区域放贷、开具汇票等都造成了银行承兑汇票垫付款纠纷日益增多。银行承兑汇票垫付款纠纷，作为民间借贷纠纷的新形式，给司法实务界造成新的难题与挑战。在司法实务操作层面，应当严格区分票据行为与普通商事行为的界限，树立正确的处理思路，及时对金融机构放松条件盲目签发承兑汇票、疏于审查基础交易关系真实性、部分单位利用银行承兑汇票进行经营活动等现象，提出司法建议。这样，既有利于保护正常、合规票据融资业务发展，为经济发展提供充足动力；又能准确打击非法金融活动，以免打击面过宽。