2009年10月28日电子商业汇票系统正式上线以来，虽然时间不长，加入电子商业汇票系统的企业也不多，电子商业汇票仍以较好的流通性、短融工具等功能吸引了银行以及广大企业的青睐。毫无疑问发展电子商业汇票是一个不容逆转的趋势。由于现行法律法规关于电子票据方面的内容相对滞后等等方面的原因，电子商业汇票安全风险问题应引起足够重视。
 
　　一、电子商业汇票信息系统安全风险

　　实际上，作为流转于电子商业汇票系统内的数据电文，电子票据所面临的风险基本上等同于信息系统所面临的安全风险。，比如数据文件丢失、系统运行瘫痪、网络遭遇攻击、各种病毒入侵等。

    二、企业信用风险

　　除了系统问题，推广电子商业汇票还应与企业的信用建设联系起来，企业的信用就是票据的信用，就是使用者对这一系统的信任度。因为如果付款期延至1年，卖方企业的信用非常重要。（可可商务）